Virus med gener kendt for videnskaben opdaget i Brasilien

Virus med gener kendt for videnskaben opdaget i Brasilien
Virus med gener kendt for videnskaben opdaget i Brasilien
Anonim

Forskere har opdaget en ny virus i Brasilien, hvis DNA er 90 procent af de gener, som videnskaben ikke kender. Resultaterne af opdagelsen offentliggøres på bioRxiv -forudskrivningsstedet.

Viruset blev opdaget i den kunstige sø Pampulha i den brasilianske by Belo Horizonte. Dens ikke meget komplekse genom består næsten udelukkende af gener, som videnskaben ikke kender. Forfatterne opkaldte den nye virus Yaravirus brasiliensis efter vandnymfen Yara fra mytologien for folkene i Sydamerika.

Forskere spekulerer i, at de står over for det første tilfælde af en ukendt isoleret gruppe af vira eller en fjern art af en kæmpe virus, der har udviklet sig til en mindre form.

Kun opdaget i det 21. århundrede når gigantiske vira størrelser, der kan sammenlignes med en bakteriecelle. De fik deres navn på grund af deres enorme kapsider - proteinmembraner, der indkapsler virioner - virale partikler. De har også DNA af den passende længde, som overstiger 200 tusinde basepar og ofte indeholder de såkaldte forældreløse eller forældreløse gener (ORFan), som ikke findes i nogen anden gruppe organismer.

Komplekse genomer gør det muligt for gigantiske vira at syntetisere proteiner og udfører derfor DNA -reparation, replikation, transkription og translation. Før deres opdagelse blev det antaget, at vira ikke har sådanne evner, da de er inaktive væsner, der kun kan inficere deres værter. Alle kendte gigantvira er parasitter af amøber.

Og selvom størrelsen på den nye mikroorganisme er betydeligt mindre end kæmpevirus - omkring 80 nanometer - parasiterer den også på amøber, og dens genom er næsten fuldstændig forældreløs: 68 af dens gener (mere end 90 procent) finder ikke analoger i enhver kendt organisme, og kun seks vagt ligner dem, som videnskaben kender.

"Dette skyldes, at virussen er en ny slægt af amøvirus med fantastisk oprindelse og fylogeni," sagde en af studielederne, Jônatas Abrahão fra Federal University of Minas Gerais i Brasilien, i en pressemeddelelse.

Forskere har analyseret mere end otte og et halvt tusinde metagenomer, men ikke blandt dem fundet vira relateret til den nye mikroorganisme. Ligesom andre vira i denne gruppe repræsenteres det af dobbeltstrenget DNA, hvis længde er 44.900 basepar og indeholder 74 kodende fragmenter.

"Ved hjælp af standardprotokoller var vores allerførste genetiske analyse ikke i stand til at opdage genkendelige capsidsekvenser eller andre klassiske virale gener i yaravirus," forklarer Yonatas Abrajao og anden studieleder Bernard La Scola fra Aix-Marseille University i Frankrig.

Ifølge de officielle metagenomiske protokoller kan yaravirus ikke engang anerkendes som et viralt middel, fordi det ikke har nogen klar lighed med dem. Forskere kan endnu ikke sige, hvad han egentlig er - en repræsentant for en helt ny gruppe eller en efterkommer af en kæmpe virus, der på en eller anden måde udviklede sig til en mindre form.

"Antallet af ukendte proteiner, der udgør yaraviruspartiklerne, afspejler den variation, der findes i den virale verden, og hvor mange nye virale genomer, der endnu ikke er opdaget," slutter forfatterne.

Anbefalede: